EMPIAR-12835 - In-situ high-resolution cryo-EM reconstructions from CEMOVIS [multiple data sets in EER and MRC formats]

EMPIAR-12835

In-situ high-resolution cryo-EM reconstructions from CEMOVIS [multiple data sets in EER and MRC formats]

Publication:

In-situ high-resolution cryo-EM reconstructions from CEMOVIS

Elferich J, Kaminek M, Kong L, Odriozola A, Kukulski W, Zuber B, Grigorieff N

International Union of Crystallography Journal (2025)

Related EMDB entry:

EMD-71068

Deposited:

2025-06-09

Released:

2025-08-27

Last modified:

2025-08-27

Imageset size:

573.04 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-12835

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
micrographs - single frame
reconstructed volumes

Image Sets

1. Unaligned multi-frame microgaphs of yeast cells sectioned using CEMOVIS

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

EER

No. of images or tilt series:

933

Image size:

(16384, 16384)

Pixel type:

SIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.2925, 0.2925)

Details:

---

Files:

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2. Aligned single-frame microgaphs of yeast cells sectioned using CEMOVIS

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

933

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.17, 1.17)

Details:

Particle positions and orientations derived from 2DTM are stored in cisTEM star format.

Files:

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3. Template used for 2DTM with omitted regions

Category:

reconstructed volumes

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(512, 512)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(None, None)

Details:

---

Files:

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Citations

Small LEA proteins mitigate air-water interface damage to fragile cryo-EM samples during plunge freezing.

Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

Outer membrane protein assembly mediated by BAM-SurA complexes.

Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

Ubiquitinated histone H2B as gatekeeper of the nucleosome acidic patch.

Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

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Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

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