EMPIAR-11855 - β2-adrenergic receptor in complex with nucleotide-free G protein Gs [multiple data sets in TIFF format]

EMPIAR-11855

β2-adrenergic receptor in complex with nucleotide-free G protein Gs [multiple data sets in TIFF format]

Publication:

Time-resolved cryo-EM of G-protein activation by a GPCR

Papasergi-Scott MM, Pérez-Hernández G, Batebi H, Gao Y, Eskici G, Seven AB, Panova O, Hilger D, Casiraghi M, He F, Maul L, Gmeiner P, Kobilka BK, Hildebrand PW, Skiniotis G

Nature (2024)

PMID: 38480881

DOI: 10.1038/s41586-024-07153-1

Related EMDB entry:

EMD-29961 EMD-29955 EMD-29966 EMD-29970 EMD-29971 EMD-29972 EMD-29965 EMD-29956 EMD-29969 EMD-29953 EMD-29952 EMD-29954 EMD-29968 EMD-29964 EMD-29959 EMD-29962 EMD-29960 EMD-29958 EMD-29967 EMD-29951

Deposited:

2024-01-08

Released:

2024-05-14

Last modified:

2024-05-14

Imageset size:

1.50 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11855

Experimental metadata:

Download xml json

Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned multi-frame micrographs of nucleotide-free β2-adrenergic receptor in complex with G protein Gs (Set 1)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

6446

Image size:

(3710, 3838)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.06, 1.06)

Details:

Raw unaligned movie files (tif format, 40 frames, not gain corrected). Collected on a Titan Krios equipped with a K2 Summit direct electron detector and post-column energy filter. The microscope was operated at 300 kV accelerating voltage. Magnified pixel size of 1.06Å. Μovies were obtained at an exposure of 1.3 electrons/Å^2/frame.

Files:

このエントリはPDBjからダウンロードすることはできません。

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

ダウンロードするファイル数やサイズによっては、膨大な時間がかかります。また、この機能は不安定で正常に動作しない可能性があり、ダウンロードされたファイルのチェックサムは検証されません。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. Unaligned multi-frame micrographs of nucleotide-free β2-adrenergic receptor in complex with G protein Gs (Set 2)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1169

Image size:

(3710, 3838)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.06, 1.06)

Details:

Files:

このエントリはPDBjからダウンロードすることはできません。

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

Browse All Files

Quick Links

Browse EMPIAR

Sample Preparation Widget

Volume Browser

Tomo Viewer Prototype

Claim entries to your ORCiD

Talks and Tutorials

EMPIAR Quick tour

Publications

Re-use study

Statistics

EMPIAR in the news

COVID-19 Data Portal

EMDB

BioImage Archive

PDBe

EMNavigator@PDBj

PDBj

Citations

High-resolution ab initio reconstruction enables cryo-EM structure determination of small particles

Kim K, Li H, Clarke OB. (2025)

Self-supervised learning for generalizable particle picking in cryo-EM micrographs.

Zamanos A, Koromilas P, Bouritsas G, Kastritis PL, Panagakis Y. (2025)

In situ structure determination of conformationally flexible targets using nextPYP.

Liu HF, Zhou Y, Huang Q, Martin J, Bartesaghi A. (2025)

CryoPROS: Correcting misalignment caused by preferred orientation using AI-generated auxiliary particles.

Zhang H, Zheng D, Wu Q, Yan N, Peng H, Hu Q, Peng Y, Yan Z, Shi Z, Bao C, Hu M. (2025)

Few-shot learning for non-vitrified ice segmentation.

Vivas-Lago A, Castaño-Díez D. (2025)

Automated removal of corrupted tilts in cryo-electron tomography.

Majtner T, Turoňová B. (2025)

Reanalysis of cryo-EM data reveals ALK-cytokine assemblies with both 2:1 and 2:2 stoichiometries.

Felix J, De Munck S, Bazan JF, Savvides SN. (2025)

Probabilistic single-particle cryo-EM ab initio 3D reconstruction in SIMPLE.

Van CTS, Reboul CF, Caesar JJE, Meana-Pañeda R, Lountos GT, Deme JC, Bryant OJ, Johnson S, Piczak CT, Valkov E, Lea SM, Elmlund H. (2025)

Cryo-EM Structure Reconstruction by Gaussian Splatting: Pushing the Resolution to Extreme

Zeng B, Liu S, Cheng S, Xu G, Fan H. (2025)

Molecular exaptation by the integrin αI domain.

Hollis JA, Chan MC, Malik HS, Campbell MG. (2025)

See all citations

Protein Data Bank Japan News

[2025-09-17]

231件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2025-09-17付）

[2025-08-24]

第63回日本生物物理学会年会にてランチョンセミナーを開催します

[2025-08-10]

IIBMP2025にてランチョンセミナーを開催します

[2025-07-17]

[wwPDB] PDBx/mmCIFフォーマットと拡張PDB IDへの移行について

[2025-06-25]

[wwPDB] EMDBアクセションコードを拡張する予定です

[2025-06-05]

第25回日本蛋白質科学会年会にてランチョンセミナーを開催します

[2025-04-22]

[wwPDB] PDBアーカイブのスナップショットは、HTTPS、SYNC、RSYNC、FTP経由でダウンロード頂けます

[2025-03-25]

PDBj Newsletter Vol.25公開のお知らせ

[2025-03-11]

[wwPDB] 生物物理学会年会にてポスター賞を授与しました

[2025-03-10]

[wwPDB] 新しいバージョンのPDB-IHM 検証レポートに、クロスリンキング質量分析に基づく構造モデルの評価が追加されました。

See all news